拟南芥泛基因组揭示全球物种保守基因组结构
德国马克斯·普朗克植物育种研究所Raphael Mercier等研究人员发现，69个拟南芥品种的泛基因组可揭示全球物种范围内的保守基因组结构。相关论文近日在线发表于《自然-遗传学》。
研究人员展示了来自全球物种范围的69个品种基因组的染色体级基因组组装。他们发现，即使在地理位置和遗传上相距甚远的品种之间，基因组的共线性也一致。在染色体臂上，兆碱基规模的重排非常罕见，通常只出现在一个品种中。这表明核型是准固定的，染色体臂上的重排是反选择的。中心粒区域显示出较高的结构动态性，核心中心粒的差异占基因组大小变化的大部分。
泛基因组分析发现了32986个不同的基因家族，其中60%存在于所有品种中、40%似乎是可有可无的，包括18%只存在于单一品种中，这表明基因多样性尚未被开发。这69个新的拟南芥基因组组装将为未来的遗传研究提供有力支持。
相关论文信息：
https://doi.org/10.1038/s41588-024-01715-9
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